Μετά από την έκδοση, πρόσφατα, των σχετικών Προεδρικών Διαταγμάτων που ορίζουν το ειδικό θεσμικό πλαίσιο προστασίας του τοπίου και της αρχιτεκτονικής κληρονομιάς των νησιών του Αιγαίου, τώρα ο κ. Σηφουνάκης θέτει σε λειτουργία έναν αποκεντρωμένο εποπτικό και ελεγκτικό οργανισμό με τη σύσταση «Τμημάτων και Γραφείων προστασίας του Περιβάλλοντος και της Αρχιτεκτονικής κληρονομιάς¦ σε 13 νησιά. Ο νέος μηχανισμός ελέγχου καλείται να επιβάλει την τάξη αφενός διατυπώνοντας τη σύμφωνη γνώμη 1) προς τις πολεοδομικές υπηρεσίες σχετικά με τις αρχιτεκτονικές μελέτες των προς έκδοση αδειών, 2) προς τις αρμόδιες επιτροπές και διευθύνσεις Τεχνικών Υπηρεσιών των Νομών για έργα υποδομής, και 3) για την εκτέλεση κάθε είδους εργασιών σε παραδοσιακούς οικισμούς και περιοχές φυσικού κάλλους και αφετέρου διενεργώντας υποχρεωτικές αυτοψίες σε διαφορετικά στάδια των οικοδομικών εργασιών. Ο νέος οργανισμός άρχισε ήδη να λειτουργεί από 1η Δεκεμβρίου με 23 διορισμένους –οι θέσεις προκηρύχθηκαν μέσω ΑΣΕΠ- επιστήμονες ενώ μέχρι το τέλος Ιανουαρίου προβλέπεται να ολοκληρωθεί και η διαδικασία ορκωμοσίας και ανάληψης των καθηκόντων άλλων 30 εμπειρογνωμόνων, αριθμός που θα αυξηθεί σταδιακά στα 100 άτομα. Με την σταδιακή πλήρη λειτουργία των νέων υπηρεσιών θα καταργηθούν, όπως εξήγησε ο κ. Σηφουνάκης, τα Συμβούλια Χωροταξίας Οικισμού και Περιβάλλοντος (ΣΧΟΠ). Ο νέος ελεγκτικός μηχανισμός, όπως τόνισε ο υπουργός, ήταν το ζητούμενο αφού σε αυτό το σημείο χωλαίνει η διαδικασία εκτέλεσης σωστών δημοσίων και ιδιωτικών έργων και με τραγικό τρόπο αλλοιώνεται η μικροκλίμακα του τοπίου του Αιγαίου. Με το νέο οργανισμό ανασυγκροτείται ο διοικητικός μηχανισμός του υπουργείου Αιγαίου, συστήνονται τέσσερις νέες Διευθύνσεις, συστήνεται με πρωτεύοντα ρόλο η Διεύθυνση Περιβάλλοντος. Επίσης συστήνονται υπο τη νέα αυτή Διεύθυνση θεματικά τμήματα και γραφεία, όπως τμήμα παραδοσιακών οικισμών, τμήμα διατηρητέων κτιρίων- περιοχών ιστορικού ενδιαφέροντος και φυσικού κάλλους, 5 τμήματα προστασίας του περιβάλλοντος και της αρχιτεκτονικής κληρονομιάς στις πρωτεύουσες των 5 νομών του Αιγαίου και τέλος 8 γραφεία προστασίας του περιβάλλοντος και της αρχιτεκτονικής κληρονομιάς στις έδρες των 8 Επαρχείων. Οι νέες περιφερειακές υπηρεσίες, όπως κατέληξε ο υπουργός, θα γίνουν κυψέλες τροφοδοσίας με την παροχή βοήθειας και γνώσης στους κατοίκους των νησιών αλλά και στον τεχνικό κόσμο του Αιγαίου. Πρόθεσή του υπουργείου Αιγαίου είναι να αποκτήσουν στο χρόνο πειστικότητα αλλά και την αξιοπιστία των Εφορειών του υπουργείου Πολιτισμού.